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基因芯片
簡要描述：
基因芯片廣泛用于模式物種的DNA、RNA和表觀遺傳等研究。豐核信息提供SNP芯片、RNA芯片、甲基化芯片分析服務，涵蓋人類和主要模式物種。
更新時間：2024-08-01
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廠商性質：其他
| 項目分類 | 名稱 | 描述 |
| Illumina SNP芯片 | Human omni-zhonghua-8 beachip | 包含90萬個位點 |
| Agilent表達譜芯片 | Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2 | 涵蓋50,599條轉錄本信息 |
| Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K | 涵蓋55,681條轉錄本信息 | |
| Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K | 涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs | |
| Agilent miRNA芯片 | Agilent Human miRNA Array V19.0 | 覆蓋2006個人類相關miRNA |
| Agilent Rat miRNA Arrary V19.0 | 覆蓋719個大鼠相關miRNA | |
| Agilent Mouse miRNA Array V19.0 | 覆蓋1247個小鼠相關miRNA | |
| Agilent 定制miRNA Array V19.0 | 可以定制數(shù)據(jù)庫包含的各個物種的相關miRNA | |
Illumina人DNA甲基化芯片服務 | IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip | 包含了450,000多個甲基化位 |
數(shù)據(jù)分析（以miRNA芯片分析為例）
標準分析
芯片預處理與標準化；
篩選差異表達microRNA；
microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等；
microRNA靶基因預測，基于多數(shù)據(jù)庫整合的靶基因預測以及上海豐核自主知識產(chǎn)權的預測軟件同時識別；
對預測的microRNA的靶基因進行GO富集分析通路富集分析等。
個性化分析
1.microRNA網(wǎng)絡分析：microRNA靶基因失調(diào)網(wǎng)絡；microNRA功能協(xié)同作用網(wǎng)絡。
2.microRNA與其他芯片整合分析：與lncRNAs芯片結果聯(lián)合分析（ceRNA Analysis）；與mRNA芯片整合分析；與DNA甲基化芯片結果聯(lián)合分析。
3.與臨床數(shù)據(jù)整合分析
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